生于海，守护海，奔赴大海——
那就是蓝色美人鱼！
怀揣着守护海洋安全的“蓝色美人鱼”职业梦想进入横须贺女子海洋学校的秋乃美咲，被任命为远洋船“晴风”的船长，与同学们一起参加海洋训练。
驾驶着船到达目的地，本该是一次安全的航行，但等待她们的却是一连串的危机。从教官船的突然开火，到与失去控制的其他学员船的战斗，再到救援船的救援活动等，她们历尽千辛万苦克服了这一切困难，最终安全返回陆地，成员之间也结下了深厚的羁绊。
风波发生一个月后，正在享受考试假期的晴风成员们又遭遇了新的危机——晴风班即将解散。在晴风班成员们受到巨大震动的同时，他们再次团结起来，终于阻止了班级的解散，进一步加深了彼此的羁绊。
之后，晴风班解散危机爆发三个月后——
在横须贺，吴、舞鹤、佐世保等女子海洋学校全体学生齐聚一堂，举行了文化祭和体育祭的“竞技比赛”。朱乃等晴风班成员也忙着准备迎新祭。
……
